Бази даних


Наукова періодика України - результати пошуку


Mozilla Firefox Для швидкої роботи та реалізації всіх функціональних можливостей пошукової системи використовуйте браузер
"Mozilla Firefox"

Вид пошуку
Повнотекстовий пошук
 Знайдено в інших БД:Журнали та продовжувані видання (1)Реферативна база даних (21)
Список видань за алфавітом назв:
A  B  C  D  E  F  G  H  I  J  L  M  N  O  P  R  S  T  U  V  W  
А  Б  В  Г  Ґ  Д  Е  Є  Ж  З  И  І  К  Л  М  Н  О  П  Р  С  Т  У  Ф  Х  Ц  Ч  Ш  Щ  Э  Ю  Я  

Авторський покажчик    Покажчик назв публікацій



Пошуковий запит: (<.>A=Gerashchenko G$<.>)
Загальна кількість знайдених документів : 8
Представлено документи з 1 до 8
1.

Gordiyuk V. V. 
Novel epigenetic markers of early epithelial tumor growth and prognosis [Електронний ресурс] / V. V. Gordiyuk, A. G. Kondratov, G. V. Gerashchenko, V. I. Kashuba // Biopolymers and cell. - 2013. - Vol. 29, № 3. - С. 215-220. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2013_29_3_7
Розглянуто генетичні та епігенетичні зміни, які відбуваються у разі утворення пухлин, та пошук перспективних наборів нових біомаркерів. Представлено дані NotI-мікрочіпів для 3-ї хромосоми людини щодо змін у пухлинах нирок, шийки матки, товстого кишечника, яєчників і легень. Знайдено локуси/гени з суттєвими змінами метилювання у зразках пухлин, які супроводжуються зниженням експресії відповідних генів. Результати мікрочіпів використано для розробки панелей епігенетичних маркерів ранньої детекції різних типів пухлин (яєчників і легенів), а також для розрізнення ступенів прогресії пухлин і виявлення метастазів. Створення подібних панелей маркерів є перспективним для застосування в клінічній медицині.
Попередній перегляд:   Завантажити - 122.591 Kb    Зміст випуску    Реферативна БД     Цитування
2.

Rudenko E. E. 
Genetic and epigenetic changes of GPX1 and GPX3 in human clear-cell renal cell carcinoma [Електронний ресурс] / E. E. Rudenko, G. V. Gerashchenko, Y. V. Lapska, O. O. Bogatyrova, S. O. Vozianov, Y. M. Zgonnyk, V. I. Kashuba // Biopolymers and cell. - 2013. - Vol. 29, № 5. - С. 395-401. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2013_29_5_7
Мета дослідження - знайти можливі діагностичні і прогностичні маркери канцерогенезу. Застосовано методи: аналіз даних SAGE і мікрочіпів, кількісна ПЛР (Q-PCR), бісульфітне секвенування, метилспецифічна ПЛР. Біоінформативним аналізом баз даних SAGE і мікрочіпів виявлено, що гени, які кодують глутатіонпероксидазу 1 і 3 (GPX1 і GPX3), мають низький рівень експресії у тканинах раку нирок. Дані Q-PCR щодо відносної експресії генів GPX1 і GPX3 підтвердили, що зазначені гени часто інактивовані у світлоклітинній карциномі нирки (ccRCC). Кореляції між рівнем експресії і метилюванням промотору у жодному разі не знайдено. Проте встановлено, що алель з п'ятьма ALA-повторами в N-кінцевій ділянці GPX1 є найчастіше повторюваним поліморфним варіантом у пацієнтів з ccRCC. Одержані дані підтверджують гіпотезу, що гени GPX1 і GPX3 залучені до процесу канцерогенезу ccRCC і можуть бути кандидатами на роль генів-супресорів пухлин (TSGs, tumor suppressor genes) при раку нирок.
Попередній перегляд:   Завантажити - 101.624 Kb    Зміст випуску    Реферативна БД     Цитування
3.

Rudenko E. E. 
PPM1M and PRICKLE2 are potential tumor suppressor genes in human clear-cell renal cell carcinoma [Електронний ресурс] / E. E. Rudenko, G. V. Gerashchenko, Y. V. Lapska, S. O. Vozianov, Y. M. Zgonnyk, V. I. Kashuba // Biopolymers and cell. - 2014. - Vol. 30, № 3. - С. 229-233. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2014_30_3_10
Мета роботи - дослідити рівень експресії PPM1M і PRICKLE2 у світлоклітинних карциномах нирки (ccRCC) і запропонувати механізм, що призводить до змін експресії генів у пухлинах. Застосовано аналіз баз даних GEO, кількісна ПЛР (Q-ПЛР), бісульфітне секвенування, метилспецифічна ПЛР, пошук делецій. Виявлено, що експресія гена PPM1M знижена у 33,3 % зразків ccRCC, у той час як гена PRICKLE2 - у 83 % зразків ccRCC. Метилювання промоторної зони і делеції в генах PPM1M і PRICKLE2 не виявлено. Висновки: одержані дані вказують на те, що PRICKLE2 і PPM1M можуть бути кандидатами в гени-супресори для ccRCC.
Попередній перегляд:   Завантажити - 78.47 Kb    Зміст випуску    Реферативна БД     Цитування
4.

Rudenko E. 
Aberrant expression of selenium-containing glutathione peroxidases in clear cell renal cell carcinomas [Електронний ресурс] / E. Rudenko, O. Kondratov, G. Gerashchenko, Y. Lapska, S. Kravchenko, O. Koliada, S. Vozianov, Y. Zgonnyk, V. Kashuba // Experimental oncology. - 2015. - Vol. 37, № 2. - С. 105-110. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/EOL_2015_37_2_6
Aim - to find putative diagnostic markers for clear cell renal cell carcinomas (ccRCQ. Quantitative polymerase chain reaction (Q-PCR), bisulfite treatment, metfaylation-specific PCR, analysis on cBioPortal for Cancer Genomics. We have found that expression of GPX1, GPX3, and GPX4 genes was decreased in ccRCC. We have shown that the number of alanine (GCG) repeats at the amino terminus of the GPX1 protein is variable. It was reported earlier that an allele that possess 5 alanine repeats is associated with the increased cancer risk. According to the obtained data, the allele with the 5 alanine repeats was also present in a group of healthy donors. Moreover, the frequency of alleles with repeats was similar among ccRCC patients and healthy individuals. We found, that decreased expression of GPXs genes was not associated with promoter metfaylation. To provide other explanation, an analysis on the gene copy number was performed. We have found the heterozygous deletions for GPX1 gene, amplification for GPX3 gene, and no change in gene copy number for GPX4. Conclusions: our data support the hypothesis that GPX1, GPX3, and GPX4 genes may play a role in ccRCC cancerogenesis and therefore they might be considered as putative diagnostic markers for ccRCC.
Попередній перегляд:   Завантажити - 142.472 Kb    Зміст випуску    Реферативна БД     Цитування
5.

Rudenko E. E. 
Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas [Електронний ресурс] / E. E. Rudenko, Y. V. Lapska, G. V. Gerashchenko, E. O. Stakhovsky, M. V. Vikarchuk, V. I. Kashuba // Biopolymers and cell. - 2015. - Vol. 31, № 1. - С. 29-33. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BPK_2015_31_1_5
Мета роботи - знайти механізм, відповідальний за зміну експресії генів PPM1M і PRICKLE2 у світлоклітинних карциномах нирки людини. Вивчення змін кількості копій генів було проведено за допомогою кількісної ПЛР (Q-ПЛР). Делеції гена PPM1M було знайдено у 55,6 % випадків, імпліфікації - у 16,7 %, а у 27,8 % зразків не було змін кількості копій гена. Виявлено делеції гена PRICKLE2 у 50 % зразків, зміни не виявлено у 38,9 % зразків, а ампліфікації спостерігалися у 11,1 % випадків. Висновки: за допомогою аналізу кількості копій гена показано, що гомо- та гетерозиготні делеції є головною причиною зміни експресії генів PPM1M і PRICKLE2.
Попередній перегляд:   Завантажити - 163.816 Kb    Зміст випуску    Реферативна БД     Цитування
6.

Gerashchenko G. V. 
Development of gene expression panels to determine prostate cancer [Електронний ресурс] / G. V. Gerashchenko, A. V. Rynditch, V. I. Kashuba // Доповіді Національної академії наук України. - 2019. - № 1. - С. 100-106. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/dnanu_2019_1_16
Досліджено адаптацію модифікованого алгоритму статистичного підходу для розробки експресійних панелей для детекції раку передміхурової залози (РПЗ). За даними моделей класифікації та регресії та статистично значущими відмінностями відносної експресії між групами аденокарцином та аденом, серед досліджуваних генів відібрано 31 транскрипт для MDR аналізу. Серед них 15 транскриптів із груп генів епітеліально-мезенхімального переходу та генів, асоційованих із РПЗ, і 16 транскриптів із груп генів пухлиноасоційованих фібробластів, пухлиноасоційованих макрофагів та імуноасоційованих генів. Із цих груп отримано ряд панелей із високими статистичними показниками. Найвищі показники діагностичних рівнів мали експресійні панелі, які розроблені з усіх п'яти груп генів: PCA3, HOTAIR, ESR1, IL1R1 (Se = 0,97, Sp = 0,85, Ac = 0,93, OR = 204); CDH2, KRT18, PCA3, HOTAIR, ESR1, IL1R1 (Se = 1,0, Sp = 0,8, Ac = 0,93, OR >> 500). Запропоновано модифікований алгоритм для аналізу даних експресії генів, який може бути використаний для розробки діагностичних панелей із добрим і високим діагностичними рівнями для стратифікації РПЗ на групі пацієнтів з української популяції. Одержані дані потребують подальшого аналізу на більшій вибірці пацієнтів із РПЗ.
Попередній перегляд:   Завантажити - 122.26 Kb    Зміст випуску    Реферативна БД     Цитування
7.

Gerashchenko G. V. 
The gene expression pattern as a tool for assessment of components of microenvironment and response to anti-cancer therapy of prostate tumors [Електронний ресурс] / G. V. Gerashchenko, L. I. Chashchina, A. V. Rynditch, V. I. Kashuba // Доповіді Національної академії наук України. - 2019. - № 4. - С. 86-93. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/dnanu_2019_4_14
Проаналізовано потенційні значення діапазонів відносної експресії ряду генів, які можуть бути залучені у відповідь на протиракову терапію, а саме AR, PTEN, COX2, FASN, HMGCR, LDLR і CTLA4, у зразках аденом, аденокарцином і парних умовно-нормальних тканин передміхурової залози. Визначено 3 підтипи аденокарцином, які показують чітку картину експресії досліджуваних генів, які характеризують: пухлино-асоційовані фібробласти; пухлиноасоційовані макрофаги; маркери імунної відповіді. Ці групи корелюють з підтипами раку передміхурової залози, які були визначені раніше на підставі аналізу відносної експресії генів, асоційованих з епітеліально-мезенхімальним переходом, і генів, пов'язаних із раком передміхурової залози. Звертає на себе увагу, що найбільша кореляція була знайдена для цих підтипів раку й групи генів пухлиноасоційованих фібробластів. Це підкреслює важливість одночасного аналізу генів, залучених до різних міжклітинних взаємодій між клітинами пухлин і клітинами пухлинного мікрооточення, в прогнозуванні ефективності протиракової терапії. Для підтвердження одержаних даних необхідні додаткові дослідження на більшій вибірці хворих на рак передміхурової залози.
Попередній перегляд:   Завантажити - 444.271 Kb    Зміст випуску    Реферативна БД     Цитування
8.

Gerashchenko G. V. 
Pattern of expression of immune- and stroma-associated genes in blood of mice with experimental B16 melanoma [Електронний ресурс] / G. V. Gerashchenko, I. M. Vagina, Y. V. Vagin, V. I. Kashuba // The Ukrainian Biochemical Journal. - 2020. - Vol. 92, № 1. - С. 5-11. - Режим доступу: http://nbuv.gov.ua/UJRN/BioChem_2020_92_1_3
Клітинні елементи пухлинної строми є гетерогенною популяцією, представленою, зокрема, пухлиноасоційованими фібробластами (ПАФ) та пухлиноасоційованими макрофагами (ПАМ). Залишається невідомим, чи можна виявити експресію ПАФ- та ПАМ-асоційованих генів у периферійній крові хворих на рак для моніторингу перебігу захворювання. Мета роботи - оцінити відносну експресію (ВЕ) пухлиноасоційованих генів у периферійній крові мишей з експериментальною меланомою. Кількісну ПЛР було використано для встановлення рівнів ВЕ 15 генів у крові інтактних C57BL/6j мишей та мишей із введеними B16 клітинами меланоми. Тести Краскела - Уолліса та точний тест Фішера з поправками на множинні порівняння за процедурою Бенжаміні - Хохбера з FDR = 0,2 було використано для статистичного аналізу. Аналіз ВЕ 15 генів виявив диференційну експресію маркерів пухлиноасоційованих фібробластів (ПАФ) та макрофагів (ПАМ) у групі мишей із введеними клітинами меланоми у порівнянні з контрольними тваринами. Так, рівні експресії маркерів ПАФ Acta2, Cxcl14, Fap та ПAM маркери Cd68, Ccl22 та Ccl17 були суттєво підвищеними, тоді як ВЕ Cd4, Cd3 та Cd8 були значно зниженими. Ці дані разом з підвищеною експресією імуносупресивного маркера Cox-2 свідчив про стійкий імуносупресивний стан експериментальних тварин із введеними клітинами меланоми. Виявлено найбільше посилення ВЕ Cox-2 (більш ніж у 20 разів), що демонструє необхідність використання COX-2 інгібіторів для лікування меланоми на додаток до відомих імунотерапевтичних методів. Одержані дані вказують, що ПАФ та ПАМ у периферичній крові мишей з експериментальними меланомами можуть бути потенційними маркерами для неінвазивного детектування прогресії пухлин.
Попередній перегляд:   Завантажити - 1.331 Mb    Зміст випуску    Реферативна БД     Цитування
 
Відділ наукової організації електронних інформаційних ресурсів
Пам`ятка користувача

Всі права захищені © Національна бібліотека України імені В. І. Вернадського